Cyklus začíná prvním dnem menstruace. Každý měsíc dozrává v jednom ze dvou
vaječníků vajíčko ve vaječníkovém váčku (
folikulu). Již před cyklem se začíná vyvíjet řada folikulů (v průměru 10–12) pro
ovulaci v příštím měsíci. Plně dozraje většinou jen jeden, zatímco ostatní zaniknou.
Dozrálý folikul měří ca. 2 cm a je naplněn folikulární tekutinou. Vajíčko se nachází ve stěně tohoto folikulu. Maximální velikosti dosahuje uprostřed cyklu. Zhruba 14. den cyklu folikul praskne a vypustí vajíčko s folikulární tekutinou do vejcovodu – dochází k ovulaci. Pomocí jemně řízených svalových kontrakcí a drobných řasinek (cilií) na vnitřní stěně vejcovodu je pak vajíčko dopravováno směrem do
dělohy.
1. Normální ženský cyklus
Dojde-li v době ovulace k pohlavnímu styku, putují vypuzené spermie z pochvy přes dělohu až do ampulární části vejcovodu. Jen jediná
spermie oplodní vajíčko, které se tam nachází.

Oplodněné vajíčko, které se nyní nazývá
embryo, se už ve vejcovodu začne rýhovat a v průměru asi 5. den po ovulaci se dostane dovnitř dělohy, kde se začne nejprve zahnizďovat.
Děložní sliznice se v každém menstruačním cyklu opětovně připravuje na zahnízdění embrya. Rostoucí folikul produkuje hormon „
estrogen“. Čím je folikul větší, tím více stoupá hladina estrogenu. Tento hormon ovlivňuje růst děložní sliznice až do doby ovulace.
Po ovulaci se folikul promění v takzvané
žluté tělísko (to způsobují granulosa buňky, jimiž je folikul vystlán, ty se po ovulaci mění ve žluté tělísko). Žluté tělísko produkuje hormon
progesteron, který natolik přestaví děložní sliznici, že embryo se v děloze může dobře zahnízdit.
Poté začne embryo vylučovat signální látku
HCG (HCG je těhotenský hormon, který lze zjistit v moči nebo v krvi a který potvrzuje těhotenství = těhotenský test).
V prvních 10-12 dnech po zahnízdění je embryo ještě tak malé, že hodnoty HCG nejsou měřitelné. Pro žluté tělísko jsou však signály dosti silné na to, aby začalo růst a produkovalo stale více progesteronu. Tento průběh je nutný, protože jinak by došlo ke krvácení.
Nedostatečná funkce žlutého tělíska
Nedostatečná produkce progesteronu je zcela normální jev, pokud se žádné embryo nezahnízdí, protože v tomto případě chybějí náležité signály. Žluté tělísko postupně zaniká a děložní sliznice se odplavuje s menstruační krví; dochází k novému cyklu.
Nástup pravidelného krvácení můžeme považovat za signál nového cyklu. To vše je řízeno velmi komplexním regulačním mechanismem vazeb mezi vaječníky,
podvěskem mozkovým (hypofýzou) a vyššími mozkovými centry.